Высшим органом управления Приюта является общее собрание членов Межрегиональной общественной организации помощи социально незащищенным гражданам «Детский Ковчег», осуществляющее руководство через президента Межрегиональной общественной организации помощи социально незащищенным гражданам «Детский Ковчег»
